ПРОГРАММНЫЙ КОМПЛЕКС МОДЕЛИРОВАНИЯ МЕТОДОМ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ ДЛЯ ГИБРИДНЫХ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫХ СИСТЕМ

И. А. Крючков, С. В. Копкин
Вопросы атомной науки и техники. Сер. Математическое моделирование физических процессов 2012. Вып.1. С. 59-65.

Для выполнения молекулярно-динамического моделирования процессов, определяющих свойства конструкционных материалов, используется программный комплекс МД. В предыдущих работах получены результаты по адаптации различных частей этого комплекса для расчетов на гибридных вычислительных системах.
       В настоящей работе приведен ряд дополнительных возможностей, учитывающих взаимодействия частиц как одинаковых, так и разных типов. Выполнено тестирование основных видов взаимодействий частиц в единой ускорительной версии программного комплекса МД. Тем самым исследуется возможность применения различных гибридных вычислительных систем, в частности, многопроцессорной вычислительной системы и специализированной компактной вычислительной системы ГВС-10 "Кубань".
       Приведено сравнение длительностей выполнения комплекса МД на основных видах задач на графических и универсальных процессорах, а также на различных графических процессорах.
       Полученные результаты показывают возможность эффективного использования арифметических ускорителей для расчета задач молекулярной динамики (рис. 7, табл. 1, список лит. - 5 назв.).